國內第一座由地方政府以BOT方式籌建，也是竹竹苗地區唯一專為零到十八歲設置的醫學中心級兒童醫院，馬偕投資金額30億打造醫學中心等級兒童醫院，規劃地下四層、地上十層建築，將取得銀級綠建築及智慧建築標章，深具指標意義。兒童醫院是以未來五十年新竹地區兒童醫療的發展需求做考量，將提供孕、產科相關門診與一條龍的婦幼醫療服務，設施包括兩座產台、新生兒中心和加護病房等，且會設置兒童早期療育中心及青少年身心發展科別，如特殊的兒童身心照護科別，並增加基因及生殖醫學、高危險妊娠等特殊醫療照護空間。